木瓜蛋白酶简称木瓜酶，对蛋白质水解的切点比较广泛，是一种广谱型蛋白酶。在饲料中添加木瓜蛋白酶的作用机理是分解饲料中蛋白质成氨基酸，加速饲料有效成分的分解和转化，增加营养物质的渗出量，提高动物的生长和饲料利用率。

对于幼龄动物，以猪为例，在出生后前2周，胃蛋白酶活性很低，2周后活性才逐渐增强；此外，断奶也会对仔猪的胃酸分泌和各种酶活表达过程产生阻碍作用，断奶后12 h内食糜中胃蛋白酶将出现明显蓄积，随后降低，直至50日龄前才明显回升。由于消化器官发育尚不健全，自身还不能够分泌足够的蛋白酶来消化饲料中的蛋白质，影响了生长及健壮，也影响饲料利用率。加入木瓜蛋白酶可以帮助消化吸收，将动物摄取的饲料蛋白质，在动物肠道内分解为氨基酸组成体组织蛋白，这个生化过程对幼龄动物生长是很重要的。

在水产养殖领域，水产动物的消化道短，消化系统不健全，消化酶类及活动远比哺乳动物低，尤其鱼虾对蛋白质要求高，且胃肠道短，更需要这种酶。加入木瓜蛋白酶制剂在水产配合饲料中效果非常显著，如混合在养鱼饲料里，有促进营养代谢及其它药物性作用；添加在对虾饲料中，对虾体增重及饲料利用率均相应得到提高；

木瓜蛋白酶60万u/g的酶活，按一吨原料加15-20g与饲料混合造粒。

那么，在饲料中添加木瓜蛋白酶，会不会增加生产成本呢？其实不然，因为在饲料中添加木瓜蛋白酶后，分解饲料中的蛋白质成氨基酸，提高饲料营养的渗出量，同时补充动物内源酶不足，增强食欲，促进动物生长，增加饲料利用率及降低饲料成本，进而提高日增重及成活力。从而减少动物的饲养成本。按一吨原料加15-20g，使用60万u/g的酶活的木瓜蛋白酶与饲料混合造粒，其木瓜蛋白酶价格第吨大概为5~6元，成本是非常划算的，何乐而不为呢！